É curadora e investigadora. A sua pesquisa – com enfoque no cruzamento das humanidades ambientais, filme experimental e artes sonoras – explora as transformações dinâmicas do ambiente e o seu impacto nas estruturas sociais e no campo da produção cultural.  Integrou na equipa curatorial da 11th Gwangju Biennale “The 8th Climate (What Does Art Do?)”, 4th Istanbul Design Biennial “A School of Schools”, e 11th Liverpool Biennale “The Stomach and the Port”. Em 2019, lançou a série de exposições Plant Revolution! (CIAJG, Museo La Tertulia), que questiona o encontro interespécies explorando diferentes narrativas de mediação tecnológica, e em 2016, curou a exposição Matter Fictions, no Museu Berardo, publicando um livro na Sternberg Press. É consultora de ONGs ambientais que trabalham sobre a mineração no mar profundo e dirigiu também diversas plataformas educacionais, como escuelita, uma escola informal do Centro de Arte Dos de Mayo – CA2M, Madrid (2017); O espaço de projectos The Barber Shop em Lisboa dedicado à pesquisa transdisciplinar (2009-16); e a plataforma de pesquisa curatorial sobre ecologia The World In Which We Occur/Matter in Flux (2014-18). Margarida Mendes é doutoranda no Centre for Research Architecture, Visual Cultures Department, Goldsmiths University of London e colabora frequentemente com o canal online de vídeo reportagem Inhabitants-tv.org